Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPB2P08579 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPB2P08579 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 997.9 ms