Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBBP07437 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBBP07437 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBBP07437 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBBP07437 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBBP07437 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBBP07437 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBBP07437 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBBP07437 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBBP07437 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBBP07437 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBBP07437 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBBP07437 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBBP07437 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBBP07437 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBBP07437 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBBP07437 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBBP07437 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBBP07437 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBBP07437 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBBP07437 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBBP07437 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBBP07437 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBBP07437 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBBP07437 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBBP07437 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBBP07437 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBBP07437 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBBP07437 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBBP07437 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBBP07437 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBBP07437 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBBP07437 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBBP07437 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBBP07437 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBBP07437 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBBP07437 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBBP07437 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBBP07437 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBBP07437 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBBP07437 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBBP07437 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBBP07437 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBBP07437 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBBP07437 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBBP07437 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBBP07437 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBBP07437 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBBP07437 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBBP07437 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBBP07437 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBBP07437 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBBP07437 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBBP07437 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBBP07437 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBBP07437 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBBP07437 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBBP07437 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBBP07437 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBBP07437 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBBP07437 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBBP07437 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBBP07437 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBBP07437 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBBP07437 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBBP07437 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms