Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPOP07202 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPOP07202 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPOP07202 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPOP07202 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPOP07202 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPOP07202 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPOP07202 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPOP07202 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPOP07202 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPOP07202 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPOP07202 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPOP07202 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPOP07202 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPOP07202 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPOP07202 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPOP07202 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPOP07202 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPOP07202 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPOP07202 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPOP07202 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPOP07202 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPOP07202 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPOP07202 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPOP07202 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPOP07202 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPOP07202 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPOP07202 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPOP07202 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPOP07202 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPOP07202 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPOP07202 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPOP07202 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPOP07202 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPOP07202 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPOP07202 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPOP07202 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPOP07202 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPOP07202 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPOP07202 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPOP07202 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPOP07202 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TPOP07202 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPOP07202 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPOP07202 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TPOP07202 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPOP07202 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPOP07202 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPOP07202 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPOP07202 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPOP07202 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPOP07202 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPOP07202 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPOP07202 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPOP07202 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPOP07202 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPOP07202 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPOP07202 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPOP07202 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPOP07202 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPOP07202 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms