Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPLP06858 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPLP06858 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPLP06858 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPLP06858 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LPLP06858 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPLP06858 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPLP06858 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPLP06858 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPLP06858 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPLP06858 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPLP06858 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPLP06858 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPLP06858 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPLP06858 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPLP06858 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPLP06858 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPLP06858 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPLP06858 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPLP06858 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LPLP06858 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LPLP06858 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LPLP06858 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPLP06858 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPLP06858 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPLP06858 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPLP06858 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPLP06858 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPLP06858 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPLP06858 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPLP06858 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPLP06858 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPLP06858 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPLP06858 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPLP06858 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPLP06858 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LPLP06858 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPLP06858 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPLP06858 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LPLP06858 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPLP06858 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPLP06858 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LPLP06858 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPLP06858 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPLP06858 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPLP06858 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPLP06858 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPLP06858 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LPLP06858 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPLP06858 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPLP06858 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPLP06858 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPLP06858 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LPLP06858 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPLP06858 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPLP06858 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LPLP06858 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LPLP06858 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPLP06858 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPLP06858 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPLP06858 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPLP06858 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms