Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGRP06401 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGRP06401 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGRP06401 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGRP06401 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGRP06401 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGRP06401 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGRP06401 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGRP06401 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGRP06401 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGRP06401 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGRP06401 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGRP06401 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGRP06401 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGRP06401 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGRP06401 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PGRP06401 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGRP06401 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGRP06401 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGRP06401 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGRP06401 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGRP06401 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGRP06401 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGRP06401 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGRP06401 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGRP06401 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGRP06401 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGRP06401 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGRP06401 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGRP06401 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGRP06401 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGRP06401 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGRP06401 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGRP06401 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGRP06401 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGRP06401 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGRP06401 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGRP06401 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGRP06401 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGRP06401 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGRP06401 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGRP06401 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGRP06401 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGRP06401 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGRP06401 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGRP06401 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGRP06401 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGRP06401 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGRP06401 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGRP06401 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGRP06401 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGRP06401 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PGRP06401 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGRP06401 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGRP06401 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGRP06401 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PGRP06401 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGRP06401 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGRP06401 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGRP06401 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGRP06401 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGRP06401 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGRP06401 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGRP06401 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGRP06401 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGRP06401 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGRP06401 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGRP06401 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PGRP06401 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGRP06401 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGRP06401 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGRP06401 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGRP06401 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGRP06401 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGRP06401 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGRP06401 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGRP06401 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGRP06401 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGRP06401 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGRP06401 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGRP06401 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGRP06401 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGRP06401 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGRP06401 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGRP06401 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGRP06401 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms