Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMG1P04279 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMG1P04279 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms