Protein–RNA interactions for Protein: P04085

PDGFA, Platelet-derived growth factor subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFAP04085 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFAP04085 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFAP04085 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFAP04085 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFAP04085 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms