Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHA1P01876 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHA1P01876 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms