Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CD4P01730 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CD4P01730 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CD4P01730 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD4P01730 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD4P01730 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD4P01730 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD4P01730 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD4P01730 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD4P01730 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD4P01730 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD4P01730 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD4P01730 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD4P01730 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD4P01730 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD4P01730 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD4P01730 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD4P01730 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD4P01730 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD4P01730 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD4P01730 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD4P01730 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD4P01730 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD4P01730 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CD4P01730 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD4P01730 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD4P01730 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD4P01730 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD4P01730 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CD4P01730 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD4P01730 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD4P01730 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD4P01730 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD4P01730 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD4P01730 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD4P01730 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD4P01730 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CD4P01730 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD4P01730 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD4P01730 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD4P01730 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD4P01730 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD4P01730 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD4P01730 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD4P01730 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD4P01730 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD4P01730 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD4P01730 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD4P01730 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CD4P01730 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD4P01730 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD4P01730 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD4P01730 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD4P01730 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD4P01730 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD4P01730 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD4P01730 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD4P01730 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD4P01730 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD4P01730 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD4P01730 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD4P01730 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD4P01730 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD4P01730 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD4P01730 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD4P01730 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD4P01730 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD4P01730 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD4P01730 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD4P01730 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD4P01730 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD4P01730 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD4P01730 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD4P01730 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD4P01730 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD4P01730 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD4P01730 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD4P01730 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD4P01730 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD4P01730 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD4P01730 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD4P01730 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD4P01730 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD4P01730 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD4P01730 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD4P01730 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CD4P01730 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD4P01730 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD4P01730 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD4P01730 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD4P01730 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD4P01730 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms