Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMP1P01033 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMP1P01033 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMP1P01033 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMP1P01033 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIMP1P01033 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMP1P01033 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMP1P01033 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIMP1P01033 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms