Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F9P00740 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
F9P00740 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F9P00740 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
F9P00740 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F9P00740 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F9P00740 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F9P00740 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F9P00740 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F9P00740 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F9P00740 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F9P00740 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
F9P00740 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
F9P00740 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
F9P00740 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F9P00740 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F9P00740 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F9P00740 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
F9P00740 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
F9P00740 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
F9P00740 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
F9P00740 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
F9P00740 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
F9P00740 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
F9P00740 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
F9P00740 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F9P00740 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
F9P00740 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
F9P00740 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
F9P00740 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F9P00740 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F9P00740 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F9P00740 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
F9P00740 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
F9P00740 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
F9P00740 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F9P00740 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F9P00740 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F9P00740 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F9P00740 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F9P00740 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F9P00740 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F9P00740 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F9P00740 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F9P00740 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
F9P00740 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F9P00740 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
F9P00740 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F9P00740 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F9P00740 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F9P00740 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F9P00740 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F9P00740 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F9P00740 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F9P00740 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F9P00740 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F9P00740 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F9P00740 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F9P00740 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F9P00740 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
F9P00740 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F9P00740 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F9P00740 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F9P00740 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F9P00740 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
F9P00740 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
F9P00740 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
F9P00740 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
F9P00740 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
F9P00740 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
F9P00740 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
F9P00740 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
F9P00740 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F9P00740 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F9P00740 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
F9P00740 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
F9P00740 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
F9P00740 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F9P00740 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F9P00740 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
F9P00740 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
F9P00740 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
F9P00740 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
F9P00740 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F9P00740 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
F9P00740 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
F9P00740 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
F9P00740 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.6 ms