Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1O96005 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPTM1O96005 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLPTM1O96005 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1O96005 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1O96005 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms