Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX58O95786 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX58O95786 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX58O95786 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX58O95786 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX58O95786 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX58O95786 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX58O95786 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX58O95786 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX58O95786 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX58O95786 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX58O95786 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX58O95786 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX58O95786 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX58O95786 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX58O95786 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX58O95786 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX58O95786 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX58O95786 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX58O95786 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX58O95786 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX58O95786 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX58O95786 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX58O95786 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDX58O95786 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDX58O95786 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDX58O95786 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX58O95786 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX58O95786 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX58O95786 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX58O95786 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX58O95786 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX58O95786 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DDX58O95786 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX58O95786 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX58O95786 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX58O95786 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX58O95786 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX58O95786 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX58O95786 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX58O95786 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX58O95786 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX58O95786 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX58O95786 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX58O95786 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX58O95786 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX58O95786 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX58O95786 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX58O95786 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX58O95786 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDX58O95786 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DDX58O95786 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DDX58O95786 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDX58O95786 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX58O95786 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX58O95786 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX58O95786 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX58O95786 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX58O95786 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX58O95786 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX58O95786 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX58O95786 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX58O95786 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX58O95786 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX58O95786 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX58O95786 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX58O95786 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX58O95786 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDX58O95786 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDX58O95786 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDX58O95786 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDX58O95786 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX58O95786 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX58O95786 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX58O95786 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX58O95786 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX58O95786 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX58O95786 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX58O95786 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX58O95786 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX58O95786 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX58O95786 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX58O95786 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX58O95786 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX58O95786 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX58O95786 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
DDX58O95786 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX58O95786 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX58O95786 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX58O95786 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX58O95786 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
DDX58O95786 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDX58O95786 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDX58O95786 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDX58O95786 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX58O95786 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX58O95786 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX58O95786 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX58O95786 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDX58O95786 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms