Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBB3O95704 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBB3O95704 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBB3O95704 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBB3O95704 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBB3O95704 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBB3O95704 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBB3O95704 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBB3O95704 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBB3O95704 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBB3O95704 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APBB3O95704 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APBB3O95704 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBB3O95704 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBB3O95704 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBB3O95704 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBB3O95704 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBB3O95704 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBB3O95704 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBB3O95704 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBB3O95704 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBB3O95704 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBB3O95704 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APBB3O95704 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBB3O95704 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBB3O95704 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBB3O95704 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBB3O95704 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBB3O95704 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBB3O95704 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBB3O95704 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APBB3O95704 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
APBB3O95704 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBB3O95704 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBB3O95704 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBB3O95704 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBB3O95704 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBB3O95704 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBB3O95704 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBB3O95704 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBB3O95704 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APBB3O95704 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBB3O95704 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBB3O95704 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBB3O95704 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBB3O95704 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBB3O95704 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBB3O95704 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBB3O95704 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBB3O95704 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBB3O95704 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBB3O95704 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBB3O95704 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBB3O95704 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBB3O95704 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APBB3O95704 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APBB3O95704 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBB3O95704 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBB3O95704 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBB3O95704 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBB3O95704 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APBB3O95704 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APBB3O95704 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBB3O95704 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBB3O95704 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBB3O95704 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APBB3O95704 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBB3O95704 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBB3O95704 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBB3O95704 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBB3O95704 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBB3O95704 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBB3O95704 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBB3O95704 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBB3O95704 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBB3O95704 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBB3O95704 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBB3O95704 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APBB3O95704 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBB3O95704 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBB3O95704 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBB3O95704 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBB3O95704 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBB3O95704 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBB3O95704 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBB3O95704 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms