Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAMBPO95630 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAMBPO95630 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms