Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE4BO95155 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4BO95155 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4BO95155 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4BO95155 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.57■■■□□ 2
UBE4BO95155 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4BO95155 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4BO95155 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4BO95155 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4BO95155 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4BO95155 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4BO95155 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4BO95155 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4BO95155 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4BO95155 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4BO95155 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4BO95155 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4BO95155 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4BO95155 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE4BO95155 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4BO95155 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4BO95155 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4BO95155 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4BO95155 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4BO95155 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4BO95155 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4BO95155 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4BO95155 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4BO95155 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms