Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSTN1O94985 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN1O94985 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN1O94985 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms