Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR47O94967 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR47O94967 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR47O94967 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR47O94967 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR47O94967 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR47O94967 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR47O94967 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR47O94967 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR47O94967 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR47O94967 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR47O94967 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR47O94967 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR47O94967 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR47O94967 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR47O94967 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR47O94967 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR47O94967 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR47O94967 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR47O94967 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR47O94967 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR47O94967 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR47O94967 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR47O94967 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR47O94967 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR47O94967 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR47O94967 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR47O94967 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR47O94967 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR47O94967 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR47O94967 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR47O94967 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR47O94967 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR47O94967 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR47O94967 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR47O94967 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR47O94967 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR47O94967 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR47O94967 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR47O94967 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR47O94967 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR47O94967 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR47O94967 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR47O94967 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR47O94967 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR47O94967 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR47O94967 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR47O94967 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR47O94967 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR47O94967 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR47O94967 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR47O94967 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR47O94967 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR47O94967 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR47O94967 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR47O94967 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR47O94967 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR47O94967 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR47O94967 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR47O94967 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR47O94967 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR47O94967 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR47O94967 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR47O94967 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR47O94967 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR47O94967 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR47O94967 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR47O94967 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR47O94967 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR47O94967 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR47O94967 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms