Protein–RNA interactions for Protein: O94941

UBOX5, RING finger protein 37, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBOX5O94941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBOX5O94941 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBOX5O94941 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBOX5O94941 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBOX5O94941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms