Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTN1O94822 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTN1O94822 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LTN1O94822 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LTN1O94822 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LTN1O94822 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTN1O94822 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTN1O94822 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTN1O94822 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTN1O94822 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTN1O94822 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LTN1O94822 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
LTN1O94822 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LTN1O94822 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LTN1O94822 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTN1O94822 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LTN1O94822 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTN1O94822 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTN1O94822 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTN1O94822 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LTN1O94822 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LTN1O94822 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LTN1O94822 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LTN1O94822 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LTN1O94822 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LTN1O94822 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LTN1O94822 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LTN1O94822 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LTN1O94822 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LTN1O94822 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LTN1O94822 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LTN1O94822 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LTN1O94822 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTN1O94822 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTN1O94822 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
LTN1O94822 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTN1O94822 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTN1O94822 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTN1O94822 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTN1O94822 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTN1O94822 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTN1O94822 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTN1O94822 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTN1O94822 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTN1O94822 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTN1O94822 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTN1O94822 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTN1O94822 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTN1O94822 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTN1O94822 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTN1O94822 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTN1O94822 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTN1O94822 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTN1O94822 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTN1O94822 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTN1O94822 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTN1O94822 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTN1O94822 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTN1O94822 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTN1O94822 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
LTN1O94822 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTN1O94822 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTN1O94822 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LTN1O94822 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTN1O94822 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTN1O94822 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTN1O94822 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTN1O94822 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTN1O94822 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTN1O94822 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTN1O94822 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTN1O94822 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTN1O94822 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTN1O94822 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTN1O94822 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTN1O94822 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTN1O94822 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LTN1O94822 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTN1O94822 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LTN1O94822 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTN1O94822 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTN1O94822 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTN1O94822 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTN1O94822 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTN1O94822 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTN1O94822 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTN1O94822 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTN1O94822 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTN1O94822 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LTN1O94822 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTN1O94822 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LTN1O94822 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LTN1O94822 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LTN1O94822 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms