Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP1O94782 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP1O94782 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP1O94782 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP1O94782 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP1O94782 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP1O94782 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP1O94782 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP1O94782 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP1O94782 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP1O94782 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP1O94782 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP1O94782 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP1O94782 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP1O94782 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP1O94782 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP1O94782 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP1O94782 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP1O94782 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP1O94782 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP1O94782 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP1O94782 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP1O94782 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP1O94782 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP1O94782 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP1O94782 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP1O94782 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP1O94782 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP1O94782 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP1O94782 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP1O94782 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP1O94782 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP1O94782 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP1O94782 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP1O94782 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP1O94782 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP1O94782 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP1O94782 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP1O94782 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP1O94782 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP1O94782 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP1O94782 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP1O94782 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP1O94782 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP1O94782 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP1O94782 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP1O94782 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP1O94782 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP1O94782 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP1O94782 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP1O94782 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP1O94782 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP1O94782 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP1O94782 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP1O94782 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP1O94782 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP1O94782 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP1O94782 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP1O94782 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP1O94782 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP1O94782 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP1O94782 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP1O94782 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP1O94782 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP1O94782 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP1O94782 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP1O94782 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP1O94782 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP1O94782 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP1O94782 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP1O94782 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP1O94782 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP1O94782 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP1O94782 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP1O94782 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP1O94782 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP1O94782 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP1O94782 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP1O94782 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP1O94782 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP1O94782 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP1O94782 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP1O94782 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP1O94782 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP1O94782 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP1O94782 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP1O94782 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP1O94782 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP1O94782 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP1O94782 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP1O94782 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP1O94782 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP1O94782 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP1O94782 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms