Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM2O94769 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM2O94769 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM2O94769 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM2O94769 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM2O94769 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM2O94769 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECM2O94769 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECM2O94769 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ECM2O94769 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ECM2O94769 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ECM2O94769 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM2O94769 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM2O94769 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM2O94769 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM2O94769 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM2O94769 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM2O94769 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM2O94769 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM2O94769 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM2O94769 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM2O94769 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM2O94769 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM2O94769 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM2O94769 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM2O94769 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM2O94769 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM2O94769 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM2O94769 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM2O94769 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECM2O94769 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECM2O94769 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM2O94769 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM2O94769 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM2O94769 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM2O94769 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM2O94769 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM2O94769 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ECM2O94769 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM2O94769 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM2O94769 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM2O94769 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM2O94769 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM2O94769 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM2O94769 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM2O94769 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM2O94769 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM2O94769 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM2O94769 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM2O94769 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM2O94769 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM2O94769 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM2O94769 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM2O94769 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM2O94769 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM2O94769 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM2O94769 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM2O94769 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM2O94769 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM2O94769 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM2O94769 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM2O94769 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM2O94769 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM2O94769 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM2O94769 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM2O94769 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM2O94769 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM2O94769 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM2O94769 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM2O94769 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM2O94769 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM2O94769 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM2O94769 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM2O94769 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM2O94769 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM2O94769 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM2O94769 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM2O94769 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM2O94769 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM2O94769 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM2O94769 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM2O94769 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM2O94769 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM2O94769 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ECM2O94769 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ECM2O94769 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM2O94769 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM2O94769 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ECM2O94769 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM2O94769 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM2O94769 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM2O94769 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ECM2O94769 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM2O94769 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms