Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP72O76094 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP72O76094 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP72O76094 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP72O76094 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP72O76094 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP72O76094 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP72O76094 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP72O76094 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP72O76094 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP72O76094 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP72O76094 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP72O76094 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP72O76094 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP72O76094 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP72O76094 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP72O76094 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP72O76094 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP72O76094 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP72O76094 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP72O76094 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP72O76094 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP72O76094 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP72O76094 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP72O76094 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP72O76094 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP72O76094 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRP72O76094 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRP72O76094 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRP72O76094 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRP72O76094 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP72O76094 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP72O76094 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP72O76094 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRP72O76094 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRP72O76094 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRP72O76094 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP72O76094 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP72O76094 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP72O76094 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP72O76094 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP72O76094 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP72O76094 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP72O76094 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRP72O76094 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRP72O76094 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP72O76094 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP72O76094 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP72O76094 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRP72O76094 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP72O76094 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP72O76094 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP72O76094 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP72O76094 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP72O76094 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP72O76094 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP72O76094 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP72O76094 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP72O76094 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP72O76094 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP72O76094 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP72O76094 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP72O76094 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP72O76094 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP72O76094 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP72O76094 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP72O76094 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP72O76094 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP72O76094 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP72O76094 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP72O76094 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP72O76094 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP72O76094 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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