Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNKO75909 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNKO75909 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNKO75909 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNKO75909 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNKO75909 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNKO75909 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNKO75909 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNKO75909 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNKO75909 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNKO75909 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNKO75909 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNKO75909 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNKO75909 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNKO75909 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNKO75909 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNKO75909 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNKO75909 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNKO75909 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNKO75909 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNKO75909 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNKO75909 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNKO75909 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNKO75909 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNKO75909 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNKO75909 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNKO75909 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNKO75909 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNKO75909 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCNKO75909 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNKO75909 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNKO75909 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNKO75909 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNKO75909 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCNKO75909 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNKO75909 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNKO75909 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNKO75909 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNKO75909 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNKO75909 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNKO75909 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNKO75909 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNKO75909 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNKO75909 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNKO75909 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNKO75909 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNKO75909 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNKO75909 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNKO75909 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNKO75909 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNKO75909 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNKO75909 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNKO75909 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNKO75909 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNKO75909 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNKO75909 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNKO75909 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNKO75909 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNKO75909 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNKO75909 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNKO75909 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNKO75909 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNKO75909 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNKO75909 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNKO75909 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNKO75909 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNKO75909 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNKO75909 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNKO75909 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNKO75909 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNKO75909 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNKO75909 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNKO75909 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNKO75909 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNKO75909 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNKO75909 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNKO75909 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNKO75909 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNKO75909 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNKO75909 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNKO75909 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNKO75909 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms