Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM4O75871 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM4O75871 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEACAM4O75871 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM4O75871 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms