Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKAP2O75563 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP2O75563 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP2O75563 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP2O75563 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms