Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP3O75074 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP3O75074 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP3O75074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP3O75074 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP3O75074 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP3O75074 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP3O75074 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP3O75074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP3O75074 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP3O75074 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP3O75074 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP3O75074 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP3O75074 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP3O75074 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP3O75074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP3O75074 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP3O75074 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP3O75074 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP3O75074 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP3O75074 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP3O75074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP3O75074 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP3O75074 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP3O75074 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP3O75074 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP3O75074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP3O75074 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP3O75074 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRP3O75074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRP3O75074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP3O75074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP3O75074 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP3O75074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP3O75074 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP3O75074 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP3O75074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP3O75074 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP3O75074 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP3O75074 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP3O75074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP3O75074 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP3O75074 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP3O75074 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP3O75074 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP3O75074 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP3O75074 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP3O75074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP3O75074 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP3O75074 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP3O75074 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP3O75074 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP3O75074 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP3O75074 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP3O75074 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP3O75074 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP3O75074 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP3O75074 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP3O75074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP3O75074 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP3O75074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRP3O75074 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRP3O75074 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP3O75074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP3O75074 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP3O75074 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP3O75074 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP3O75074 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP3O75074 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP3O75074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP3O75074 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP3O75074 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP3O75074 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP3O75074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP3O75074 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP3O75074 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP3O75074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP3O75074 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP3O75074 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP3O75074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP3O75074 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP3O75074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP3O75074 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP3O75074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP3O75074 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms