Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PFDN1O60925 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN1O60925 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN1O60925 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms