Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A2O60779 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A2O60779 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms