Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX6O43752 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STX6O43752 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STX6O43752 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX6O43752 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX6O43752 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX6O43752 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX6O43752 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX6O43752 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX6O43752 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX6O43752 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX6O43752 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX6O43752 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX6O43752 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX6O43752 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX6O43752 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX6O43752 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX6O43752 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX6O43752 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
STX6O43752 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX6O43752 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX6O43752 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STX6O43752 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STX6O43752 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STX6O43752 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STX6O43752 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STX6O43752 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX6O43752 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX6O43752 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX6O43752 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX6O43752 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX6O43752 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX6O43752 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX6O43752 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX6O43752 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX6O43752 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX6O43752 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX6O43752 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
STX6O43752 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX6O43752 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX6O43752 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX6O43752 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX6O43752 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX6O43752 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX6O43752 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX6O43752 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STX6O43752 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STX6O43752 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STX6O43752 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
STX6O43752 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STX6O43752 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX6O43752 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX6O43752 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX6O43752 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX6O43752 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX6O43752 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX6O43752 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
STX6O43752 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX6O43752 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX6O43752 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX6O43752 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX6O43752 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX6O43752 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX6O43752 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX6O43752 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX6O43752 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX6O43752 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX6O43752 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX6O43752 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX6O43752 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX6O43752 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX6O43752 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX6O43752 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
STX6O43752 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX6O43752 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX6O43752 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX6O43752 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX6O43752 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX6O43752 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX6O43752 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX6O43752 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX6O43752 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX6O43752 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX6O43752 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX6O43752 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX6O43752 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX6O43752 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX6O43752 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX6O43752 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX6O43752 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STX6O43752 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STX6O43752 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
STX6O43752 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX6O43752 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX6O43752 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX6O43752 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX6O43752 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STX6O43752 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STX6O43752 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
STX6O43752 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms