Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKAB2O43741 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKAB2O43741 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKAB2O43741 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms