Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BUD23O43709 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BUD23O43709 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BUD23O43709 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BUD23O43709 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BUD23O43709 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BUD23O43709 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BUD23O43709 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BUD23O43709 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BUD23O43709 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BUD23O43709 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BUD23O43709 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BUD23O43709 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BUD23O43709 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BUD23O43709 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BUD23O43709 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BUD23O43709 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BUD23O43709 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BUD23O43709 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BUD23O43709 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BUD23O43709 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BUD23O43709 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BUD23O43709 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BUD23O43709 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BUD23O43709 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BUD23O43709 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BUD23O43709 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BUD23O43709 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BUD23O43709 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BUD23O43709 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BUD23O43709 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BUD23O43709 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BUD23O43709 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BUD23O43709 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BUD23O43709 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BUD23O43709 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BUD23O43709 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BUD23O43709 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BUD23O43709 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BUD23O43709 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BUD23O43709 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BUD23O43709 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BUD23O43709 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BUD23O43709 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BUD23O43709 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BUD23O43709 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BUD23O43709 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BUD23O43709 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BUD23O43709 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BUD23O43709 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BUD23O43709 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BUD23O43709 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BUD23O43709 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BUD23O43709 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BUD23O43709 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BUD23O43709 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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