Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC26A4O43511 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC26A4O43511 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC26A4O43511 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC26A4O43511 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC26A4O43511 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms