Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA3O43365 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA3O43365 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA3O43365 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms