Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRXO43186 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CRXO43186 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRXO43186 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CRXO43186 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRXO43186 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRXO43186 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRXO43186 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRXO43186 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRXO43186 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRXO43186 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRXO43186 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRXO43186 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRXO43186 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRXO43186 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRXO43186 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRXO43186 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRXO43186 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRXO43186 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRXO43186 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRXO43186 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRXO43186 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRXO43186 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRXO43186 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRXO43186 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRXO43186 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRXO43186 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRXO43186 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRXO43186 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRXO43186 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRXO43186 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRXO43186 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRXO43186 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRXO43186 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRXO43186 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRXO43186 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRXO43186 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms