Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP1O15126 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP1O15126 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP1O15126 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP1O15126 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms