Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNMO15061 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNMO15061 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNMO15061 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNMO15061 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNMO15061 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNMO15061 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNMO15061 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNMO15061 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNMO15061 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SYNMO15061 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNMO15061 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNMO15061 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNMO15061 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNMO15061 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNMO15061 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNMO15061 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNMO15061 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNMO15061 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNMO15061 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNMO15061 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNMO15061 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNMO15061 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNMO15061 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNMO15061 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNMO15061 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNMO15061 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNMO15061 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNMO15061 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNMO15061 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYNMO15061 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNMO15061 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNMO15061 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNMO15061 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNMO15061 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNMO15061 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNMO15061 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNMO15061 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNMO15061 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYNMO15061 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYNMO15061 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNMO15061 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNMO15061 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNMO15061 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SYNMO15061 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SYNMO15061 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNMO15061 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNMO15061 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNMO15061 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNMO15061 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNMO15061 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNMO15061 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNMO15061 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNMO15061 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNMO15061 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SYNMO15061 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SYNMO15061 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SYNMO15061 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNMO15061 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNMO15061 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNMO15061 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNMO15061 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNMO15061 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNMO15061 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNMO15061 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNMO15061 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNMO15061 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNMO15061 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNMO15061 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNMO15061 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNMO15061 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNMO15061 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNMO15061 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNMO15061 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNMO15061 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNMO15061 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNMO15061 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNMO15061 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNMO15061 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNMO15061 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNMO15061 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNMO15061 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms