Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKO14936 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKO14936 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKO14936 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKO14936 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKO14936 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKO14936 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKO14936 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKO14936 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKO14936 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKO14936 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKO14936 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKO14936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKO14936 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKO14936 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKO14936 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKO14936 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASKO14936 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKO14936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKO14936 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKO14936 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKO14936 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKO14936 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKO14936 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKO14936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKO14936 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKO14936 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKO14936 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKO14936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKO14936 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKO14936 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKO14936 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKO14936 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKO14936 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKO14936 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKO14936 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKO14936 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKO14936 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKO14936 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKO14936 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKO14936 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKO14936 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKO14936 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASKO14936 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKO14936 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKO14936 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKO14936 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASKO14936 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKO14936 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKO14936 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKO14936 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKO14936 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKO14936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKO14936 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKO14936 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKO14936 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKO14936 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKO14936 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKO14936 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASKO14936 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms