Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GIPC1O14908 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GIPC1O14908 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC1O14908 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC1O14908 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms