Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRPO00591 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRPO00591 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRPO00591 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRPO00591 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRPO00591 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRPO00591 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRPO00591 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRPO00591 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRPO00591 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRPO00591 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRPO00591 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRPO00591 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRPO00591 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRPO00591 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRPO00591 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRPO00591 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRPO00591 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRPO00591 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRPO00591 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRPO00591 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRPO00591 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRPO00591 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRPO00591 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRPO00591 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRPO00591 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRPO00591 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRPO00591 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRPO00591 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRPO00591 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRPO00591 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRPO00591 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRPO00591 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRPO00591 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRPO00591 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRPO00591 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRPO00591 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRPO00591 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRPO00591 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRPO00591 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRPO00591 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRPO00591 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRPO00591 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRPO00591 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRPO00591 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRPO00591 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRPO00591 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRPO00591 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRPO00591 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRPO00591 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRPO00591 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRPO00591 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRPO00591 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRPO00591 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRPO00591 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRPO00591 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms