Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBAG9O00559 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBAG9O00559 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms