Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC1O00299 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC1O00299 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC1O00299 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLIC1O00299 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms