Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIP1O00291 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIP1O00291 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIP1O00291 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIP1O00291 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIP1O00291 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIP1O00291 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIP1O00291 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIP1O00291 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIP1O00291 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIP1O00291 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIP1O00291 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIP1O00291 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIP1O00291 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIP1O00291 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIP1O00291 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIP1O00291 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIP1O00291 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIP1O00291 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIP1O00291 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIP1O00291 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIP1O00291 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIP1O00291 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIP1O00291 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIP1O00291 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIP1O00291 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIP1O00291 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIP1O00291 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIP1O00291 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HIP1O00291 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIP1O00291 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIP1O00291 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIP1O00291 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIP1O00291 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIP1O00291 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIP1O00291 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIP1O00291 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIP1O00291 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIP1O00291 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIP1O00291 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIP1O00291 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIP1O00291 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIP1O00291 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HIP1O00291 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIP1O00291 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIP1O00291 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIP1O00291 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIP1O00291 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIP1O00291 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIP1O00291 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIP1O00291 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIP1O00291 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIP1O00291 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIP1O00291 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIP1O00291 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIP1O00291 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIP1O00291 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIP1O00291 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIP1O00291 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIP1O00291 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIP1O00291 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HIP1O00291 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIP1O00291 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HIP1O00291 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
HIP1O00291 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIP1O00291 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIP1O00291 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIP1O00291 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HIP1O00291 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIP1O00291 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIP1O00291 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIP1O00291 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIP1O00291 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIP1O00291 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIP1O00291 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIP1O00291 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIP1O00291 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIP1O00291 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIP1O00291 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIP1O00291 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIP1O00291 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIP1O00291 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIP1O00291 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HIP1O00291 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIP1O00291 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HIP1O00291 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIP1O00291 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIP1O00291 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIP1O00291 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIP1O00291 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIP1O00291 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIP1O00291 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIP1O00291 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms