Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NFKBIEO00221 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NFKBIEO00221 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFKBIEO00221 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFKBIEO00221 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NFKBIEO00221 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NFKBIEO00221 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms