Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF10AO00220 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF10AO00220 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFRSF10AO00220 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFRSF10AO00220 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms