Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms