Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP23O00161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SNAP23O00161 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP23O00161 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP23O00161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP23O00161 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms