Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms