Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8VP50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8VP50 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8VP50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8VP50 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8VP50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F8VP50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F8VP50 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
F8VP50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
F8VP50 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F8VP50 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F8VP50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F8VP50 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
F8VP50 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F8VP50 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8VP50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8VP50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8VP50 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8VP50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F8VP50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F8VP50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F8VP50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F8VP50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F8VP50 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F8VP50 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8VP50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F8VP50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VP50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VP50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VP50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F8VP50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F8VP50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VP50 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VP50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VP50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F8VP50 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VP50 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VP50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VP50 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VP50 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F8VP50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F8VP50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F8VP50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F8VP50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F8VP50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VP50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VP50 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VP50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F8VP50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VP50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VP50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VP50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
F8VP50 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VP50 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VP50 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VP50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VP50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F8VP50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VP50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VP50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VP50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F8VP50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
F8VP50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
F8VP50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VP50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VP50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VP50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VP50 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
F8VP50 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VP50 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VP50 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F8VP50 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VP50 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VP50 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VP50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VP50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F8VP50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VP50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VP50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VP50 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VP50 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F8VP50 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms