Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PATL2C9JE40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PATL2C9JE40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PATL2C9JE40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PATL2C9JE40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms