Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNL1A8MU46 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMTNL1A8MU46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMTNL1A8MU46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms